底生生物のDNAデータベースをリリースします

底生生物のDNAデータベースをリリースします。

昨年11月の環境DNA学会で発表した通り、弊社は株式会社生物技研様と共同で、底生動物ユニバーサルプライマーgBenthosのためのDNAデータベース整備を進めてきました。ようやく2020年9月より、ご利用いただけるようになりました。

公開データベースとの解析精度比較

公開データベースとオリジナルデータベースを用いて、それぞれ環境DNA分析を行いました。
下図の通り、オリジナルデータベースを用いると、公開データベースにみられた90％付近のピークが小さくなり、データベースと100％一致したOTU配列が増加しました。

下表は系統推定結果の抜粋です。オリジナルデータベースを用いると、種同定できる配列が増加しました。

形態分類分析と環境DNA分析との比較結果

形態分類による分析と環境DNA分析の両手法で得られた結果の比較を行いました。結果は下リンクよりご確認下さい。